در این پژوهش، روشی نوین برای تشخیص و شناسایی سریع پنج سویه‌ی ویروس برونشیت عفونی (IBV) طراحی و بهینه‌سازی شد. سویه‌های مورد بررسی شامل دو سویه‌ی وحشی QX و G VI-1 بودند که در حال حاضر شیوع دارند، به همراه سه سویه‌ی Mass، 91/4 و LDT3 که در فرمولاسیون واکسن‌های دامپزشکی مورد استفاده قرار می‌گیرند. بر اساس توالی‌های ژنی گلیکوپروتئین اسپایک ۱ (S1) در سویه‌های مذکور، پنج جفت پرایمر اختصاصی و سفارشی‌سازی‌شده طراحی و سنتز گردید. این پرایمرها به گونه‌ای انتخاب شدند که به توالی‌های پایدار و اختصاصی هر سویه متصل شده و از تداخل متقاطع جلوگیری کنند. پس از چندین مرحله بهینه‌سازی و آزمایش‌های متعدد، یک روش تشخیص PCR چندگانه با اختصاصیت بالا برای شناسایی هم‌زمان سویه‌های وحشی QX و G VI-1 و سویه‌های Mass، 91/4 و LDT3 طراحی شد. شرایط بهینه‌ی واکنش شامل غلظت نهایی 1/0 میکرومولار برای پرایمرهای بالادستی و پایین‌دستی، دمای آنیلینگ ۵۸ درجه سانتی‌گراد و ۳۵ چرخه تکثیر بود. آزمون اختصاصیت نشان داد که این سیستم می‌تواند قطعات هدف مورد انتظار هر سویه را به‌طور دقیق تقویت کند، بدون اینکه باعث تداخل متقاطع با سایر سویه‌ها شود. برای ارزیابی حساسیت، از پلاسمیدهای نوترکیب به‌عنوان الگو استفاده شد و حداقل حد تشخیص، ۱۰ به توان ۳ کپی در هر میکرولیتر تعیین شد. نتایج، حساسیت بالای این روش را نشان داد. در مرحله بعدی، این روش برای شناسایی عفونت‌های ترکیبی عمدی تشکیل‌شده از دو، سه، چهار یا پنج سویه IBV  که در بالا ذکرشده، در نمونه‌های جنین مرغ به‌کار گرفته شد. تمام نمونه‌های آلوده‌شده عمدی، نوارهای تقویتی(amplified bands) مورد انتظار را نشان دادند. با به‌کارگیری این روش، امکان تشخیص صحیح نمونه‌های بافتی مرغ مشکوک به عفونت IBV، و نیز نمونه‌های سواپ بالینی حلق و مقعد از مزارع مختلف مرغ تخم‌گذار فراهم گردید. به طور خلاصه، روش تشخیصی چندتایی PCR ایجادشده در این پژوهش، اثرات کاربردی مثبتی در زمینه بالینی داشته و یک راهکار فنی نوین برای شناسایی و تشخیص سریع پنج ژنوتیپ سویه IBV ارائه می‌دهد.